Les localités et villes les plus peuplées se trouvent en Biscaye, dans le Guipúzcoa et en Navarre, où le plus grand nombre d’habitants est concentré dans des zones de petite superficie. Portugalete (14 075 habitants/km²) et Barañáin (14 048 habitants/km²) sont les communes à plus forte densité de population du Pays Basque, suivies de Burlada, Villava, Bilbao et Pampelune, toutes d’une densité de population supérieure à 8 000 habitants/km². Il existe également des communes à fortes densités autour des grands centres urbains comme Santurtzi, Basauri et Getxo. Dans certaines communes plus petites, en revanche, la densité est nettement inférieure, avec moins de 100 habitants/km², en raison de leur population plus dispersée. Les dix villages à plus faible densité sont : Gallipienzo, Ujué, Larrau, Güesa, Roncevaux, Navascués, Petilla de Aragón, Ezprogui, Urraúl Alto, Castillo-Nuevo.
Par rapport à d’autres régions européennes, le Pays Basque possède en général une densité moyenne, mais, dans ses zones urbaines, on peut observer des lieux de forte densité, comparables à d’autres grandes villes européennes comme Berlin, Bruxelles et certains quartiers d’Île-de-France. D’autre part, les zones rurales du Pays Basque présentent davantage de similitudes avec d’autres régions montagneuses et rurales plus dispersées en Europe. Ainsi, le Pays Basque montre des contrastes concernant la densité et la répartition de la population : une grande concentration dans les aires métropolitaines et une dispersion plus importante en milieu rural.